Основной чертой, сразу бросающейся в глаза, является бережно сохраняемая природная среда страны. Каждый клочок земли, даже зажатый среди небоскребов крохотный газончик, может быть превращён в мини-заповедник, любой крохотный пруд или лужайка может быть местной святыней, за которой ухаживает и следит вся округа. Множество бережно сохраняемых исторических памятников, зданий и храмов рассредоточено по всей территории страны, поэтому Япония производит неизгладимое впечатление на каждого, кто хоть раз побывал в этой стране.
Символами страны, миллионами растиражированными на всех открытках и буклетах о стране, являются самые большие «священные ворота» («тории») в Японии — деревянные ворота (1875 г.) святилища Ицукусима на «священном» острове Миядзима. стоящие прямо в воде в маленькой бухте (сам монастырь, одна из наиболее почитаемых святынь Японии, тоже стоит на сваях прямо в воде), а так же знаменитая гора Фудзи (Фудзияма, 3 776 м.) — один из самых красивых вулканов в мире, окруженный не менее живописными окрестностями. Таким же символом страны считается и мост Сэто-Охаси (1988 г.), перекинутый через Внутреннее Японское море (Сэто) от Хонсю до Сикоку. Япония производит лучший в мире жемчуг, поэтому многочисленные «жемчужные фермы» являются и интересными туристическими объектами, которые посещают до полумиллиона иностранных туристов в год.
Токио (до 1868 г. — Эдо) — один из крупнейших городов мира, основанный в середине XV в. по образу и подобию древней китайской столицы Чанъянь (ныне Сиань) сёгуном Токугава. До наших дней этот гигантский мегаполис сохранил множество старых деревянных зданий и храмов, придающих ему, по контрасту с суперсовременными кварталами, особое очарование.
В 150 км к северо-востоку от Токио находится национальный парк Никко с живописными озерами (самое красивое — Тюдзэнси или Чузенджи), водопадами Кэгон и Ширакумо, ущельями и горячими источниками «онсэн » в обрамлении красивых святилищ Тосегу, Футаарасан, Рицуин и Тайюин. Здесь находилась резиденция сёгуна Токугавы Иэясу, а его могила и в наши дни является местом паломничества многочисленных туристов. Жемчужиной курорта является храмовый комплекс Тосегу, включающий 23 памятника архитектуры, в том числе знаменитую пятиярусную пагоду и храм Якусидо. Через водные потоки перекинуты многочисленные живописные мосты, самым красивым из которых считается «священный мост» Синкё. На западном склоне горы Нантай, с расположенным на ней буддийским храмом Тачи-Ки-Каннон, находится обрыв, в верхней части которого расположены пещеры Казаана («пещеры ветра»), из которых дважды в год — весной и осенью — дует сильный ветер. Здесь растет множество деревьев, цветение которых доставляет такое удовольствие японцам, поэтому весной (да и в любое другое время года) здесь множество туристов. А в Омии (30 км северо-восточнее Токио) интересен уникальный Парк Бонсаи (традиционное японское искусство выращивания карликовых деревьев).
В 32 км юго-западнее Токио лежит второй по величине город страны — Йокогама (фактически он уже слился с «большим Токио»). Между Токио и Йокогамой лежит город Кавасаки (также слился с Токио).
Нара — первая императорская столица страны (710-784 гг.), настоящий музей под открытым небом.
Киото основан в 792-794 гг. и до 1868 г. под именем Хэйан («город мира и спокойствия») официально считался столицей страны и резиденцией императора. Это необыкновенно красочный и романтичный город, признанный центр международного туризма. Здесь находится около 2000 храмов и церквей (из них 17 находятся под защитой ЮНЕСКО), сотни парков и десятки старинных дворцов. Особое очарование Киото придает неповторимая гармония всех его многочисленных сооружений с окружающим ландшафтом.
Расположенная на побережье Тихого океана Камакура — древнейшая столица Японии, место паломничества и популярнейший морской курорт Японии.
На юго-западе острова Хонсю расположен город Кобе — первый район поселения европейцев на островах и один из крупнейших портов мира, город международных выставок и «пионер» в создании искусственных островов.
Популярен у туристов и город Нагоя .
В районе города Беппу расположен один из самых крупных районов выхода подземных термальных вод на планете.
Второй по величине остров Японии — северный Хоккайдо («путь к северным морям»), считается самым малонеселенным и «зеленым» островом архипелага. Около 10% площади острова занимают более 20 национальных парков, что делает его признанным центром активного туризма страны.
Многочисленные национальные парки, в т. ч. такие известные, как Дайсецудзан, Бандай-Асахи, Никко, Кирисима с водопадом Сенригатаки, Сето-Найкай, Сикоцу-Тоя, Чичибу-Тама, Фудзи-Хаконе-Идзу. подводные природные парки, заповедники и резерваты, хотя и относительно невелики по размерам, но обладают непередаваемым национальным колоритом.